Muchos virus diferentes son la causa más común de faringitis.

Las bacterias que pueden ocasionarla abarcan estreptococos del grupo A, que llevan a la amigdalitis estreptocócica (existen múltiples cepas que pueden ocasionar una erupción por escarlatina) en algunos casos.

Otras bacterias menos comunes que causan dolores de garganta comprenden Corynebacterium, Arcanobacterium, Neisseria gonorrhoeae y Chlamydia pneumoniae.

La mayoría de las faringitis ocurren durante los meses más fríos y la enfermedad con frecuencia se propaga entre los miembros de la familia.